در 6 نوامبر 1986، فرگوسن که تنها یک هفته از تولد 46 سالگی اش می گذشت، ابردین را رها کرد تا به عنوان جانشین ران اتکینسون معزول هدایت منچستر یونایتدرا به دست بگیرد.
به گزارش کاپ، سه روز بعد از این قرارداد،نوبت به بازی مقابل آکسفورد رسید و از همان زمان بود که برگ جدیدی از تاریخ فوتبال منچستر و لیگ انگلستان ورق خورد. فرگوسن مطابق سیستم مرسوم ان ایان منچستریونایتد را با سیستم 2-4-4 و با ترکیب ترنر، آلبیستون، موران، هوگ، داگسبری،بارنز، موزز، مک گراث، بلک مور،استناپلتون و داونپوئرت به میدان فرستاد اما چیزی جز باخت(2-0) کسب نشد. از همان روزها مشخص بود که این منچستر برای تغییرات و رسیدن به موفقیت نیاز به معجزه دارد.
اولین سال فرگوسن در یونایتددر روزهایی که هر برد تنها 2 امتیاز داشت، فصل 87-86 در حالی به پایان رسید که اورتون با 86 امتیاز قهرمان شد و لیورپول 77 امتیازی نیز دوم شد. تاتنهام(71)، آرسنال(70)، نورویچ(68)، ویمبلدون(66)،لوتون(66)، ناتینگهام فارست(65)، واتفورد(63)،و کاونتری(63) امتیاز عناوین سوم تا دهم را از آن خود کردند و شاگردان فرگوسن با 14 برد، 14 تساوی و 14 شکست و با 52 گل زده و 45 گل خورده عنوان یازدهم را از آن خود کردند!
