به گزارش "ورزش سه"، دوران وزارت محمود گودرزی با حاشیه های زیادی به پایان رسید. بحث دخالت های او در امور پرسپولیس و استقلال و جانبداری از یک تیم یکی از حاشیه هایی بود که برای وزیر پیشین هزینه های زیادی ایجاد کرد.
رضا افتخاری که در روزهای پایانی وزارت محمود گودرزی به عنوان مدیرعامل استقلال منصوب شد، در واکنش به ادعای پرسپولیسی بودن گودرزی واکنش جالبی دارد: «گودرزی از استقلال بیشتر حمایت میکرد تا پرسپولیس و حتی سر تمرین ما هم آمد. اگر بحث نقل و انتقالات است همان پولی که پرسپولیس به بازیکنان داد، استقلال هم همان پول را به بازیکنانش پرداخت کرد. پرسپولیس از جای دیگری حمایت شد.»
تجمع هواداران آبی ها برابر مجلس و وزارت ورزش از جمله حاشیه هایی بود که در واکنش به ادعای پرسپولیسی بودن گودرزی رخ داد. واکنش هایی که شاید در کنار درخواست هواداران استقلال برای ورود به وزارت ورزش یکی از عوامل تاثیرگذار در استعفای گودرزی بوده است.