در چنین روی در سال 2002، مورینیو هدایت پورتو را بر عهده گرفت.
به گزارش کاپ، ژوزه مورینیو پیش از آمدن به چلسی، اینترمیلان، رئال مادرید، چلسی و منچستریونایتد، هدایت تیمی را عهده دار بود به نام پورتو. او در پورتو دوران فوق العاده ای را سپری کرد و به نوعی با همان افتخارات بود که به دنیای بزرگ فوتبال معرفی شد.
افتخارات مورینیو به همراه پورتو، قهرمانی در لیگ برتر(2003-2004)، کاپ پرتغال(2003)، کاپ یوفا(2003)، لیگ قهرمانان(2004)، و سوپر کاپ پرتغال(2003) است. او در مجموع شش جام با پورتو بالای سر برد.